Дубликат записей: sawer.blog.ru
Люди, не публикующие руководства к своим продуктам, поступают дурно! 
Объект класса mtm:
Найдено методом тыка;
доковыряться до разработчиков.

Объект класса mtm:
freq - список частот;
mtm$Ftest -уровни значимости для вклада каждой из частот значение F-статистики.
Объект класса mtm.coh:mtm$Ftest -
msc - cписок значений функции распределения Фишера (CDF for Independent Data).
Найдено методом тыка;

Спорный подход. А документацию я сам написал бы — но тут нужно хорошо шарить в той узкой области, которой посвящён этот пакет. Если б я так хорошо разбирался, то обошёлся бы и без доков.